Основната причина за появата на мухъл е комбинацията от влага, топлина и недостатъчна вентилация – условия, които банята предлага в изобилие. Фугите между плочките са порести и задържат вода, сапунени остатъци и замърсявания, което създава идеална среда за развитие на гъбични микроорганизми.
Допълнителен фактор е лошото качество или остаряването на фугиращата смес. С времето тя губи защитните си свойства, напуква се и започва да абсорбира още повече влага. Липсата на редовно почистване и проветряване ускорява този процес и позволява на мухъла да се разпространи бързо.